Specijalno tužilaštvo podiglo je optužnicu protiv Stojić Mirka zbog krivičnog djela Zloupotreba službenog položaja ili ovlašćenja i krivičnog djela Primanja mita. Optužnica Stojića tereti da je u periodu obavljanja dužnosti generalnog sekretara, odnosno šefa kabineta predsjednika Republike Srpske, iskoristio svoj službeni položaj, zaključivajući fiktivne ugovore o vršenju raznih vrsta usluga prilikom rekonstrukcije i adaptacije palate Predsjednika Republike Srpske, bez realizacije tih ugovora i bez namjere stvarne realizacije tih ugovora.
Stojiću se stavlja na teret i zaključivanje fiktivnog ugovora o zakupu stana za potrebe službe predsjednika, a svoj službeni položaj je iskoristio i utvrđujući sebi, bez pravnog osnova, pravo na novčanu naknadu na ime obavljanja dodatnih poslova iz nadležnosti generalnog sekretara, odnosno šefa kabineta predsjednika Republike Srpske.
U namjeri pribavljanja protivpravne imovinske koristi, prema navodima optužnice, Stojić je iskoristio svoj položaj i u vrijeme pripremanja sahrane pokojnog predsjednika Republike Srpske, na način da je iz budžeta Republike Srpske isplaćena novčana naknada za usluge snimanja i pripreme sahrane, iako takve usluge nisu vršene, s obzirom da je po Odluci Vlade troškove sahrane snosila Vlada Republike Srpske.
Istragom je utvrđeno da je Stojić nezakonitim radnjama koje mu se stavljaju na teret, a koje su precizirane u sedam tačaka optužnice, sebi ili drugom pribavio ili imao namjeru da pribavi protivpravnu imovinsku korist u iznosu od preko 350.000,00 KM.